Las constraints de una tabla de SQL Server se pueden desactivar temporalmente con la opción NOCHECK CONSTRAINT ALL de ALTER TABLE.
El comando quedaría así:

 ALTER TABLE tabla NOCHECK CONSTRAINT ALL;

Con esto se desactivan y puedes hacer la carga de datos sin que te molesten las FK

Después, para volver a activarlas sólo tienes que hacer este otro ALTER TABLE:

 ALTER TABLE tabla WITH CHECK CHECK CONSTRAINT ALL;

Reactiva las constraints chequeando que los datos de las tablas las cumplan

Si quieres volver a habilitarlas sin validar los datos que hayas cargado, aunque no es muy recomendable también se puede hacer:

 ALTER TABLE tabla CHECK CONSTRAINT ALL;